En el Laboratorio de Hidroacústica Aplicada, bajo la coordinación de los profesores Stefan Weigert y Lauro Saint Pastous Madureira, se desarrollan proyectos de investigación pesquera y ecológica. Hay un equipo de investigadores especializados en el uso de equipos hidroacústicos para la prospección, cartografía y estimación de la biomasa de peces pelágicos, y en el análisis de la interacción entre los organismos marinos y las condiciones ambientales y oceanográficas.

Debido a la naturaleza de los estudios que se llevan a cabo en el Laboratorio de Tecnología Pesquera e Hidroacústica, son frecuentes las oportunidades de embarcarse tanto en buques de investigación como en barcos de pesca, lo que proporciona una gran experiencia en el mar a su equipo de investigadores.