Los estudiantes y profesores de PPGOB investigan temas de diferentes áreas de la oceanografía, desde cuestiones ecológicas básicas hasta investigaciones más aplicadas. PPGOB actúa de manera interdisciplinaria, interactuando con otras áreas de la oceanografía y otras ciencias, avanzando en el conocimiento sobre el uso, manejo y conservación de los recursos marinos, sobre las amenazas a la integridad de los océanos y sus organismos e incluso sobre el desarrollo tecnológico y la innovación. Las líneas de investigación de PPGOB se dividen en: